Líneas de investigación     Síntesis curricular      Publicaciones

Líneas de investigación

En mi laboratorio, actualmente estamos trabajando en las siguientes líneas de investigación:

• Interacción insecto-planta-microorganismo, con énfasis en insectos de importancia agrícola y forestal.
• Evaluación de las respuestas moleculares de insectos a diversos tipos de estreses ambientalmente relevantes en el contexto del cambio climático. 
• Caracterización de genes y proteínas de insectos con potencial biotecnológico

Para alcanzar nuestros objetivos, en todas las líneas estamos haciendo uso de múltiples enfoques que incluyen principalmente herramientas de ingeniería genética, bioquímica, biología molecular, ciencias ómicas y bioinformática. También estamos abiertos a colaborar en proyectos que se puedan resolver con el estas herramientas, o bien, con estrategias cercanas dentro del área de las ciencias biomoleculares. 

Síntesis curricular

• Ingeniero en Biotecnología (2007 – 2012).  Universidad   Autónoma   de   Chiapas. 

• Maestro en Ciencias Bioquímicas (2012 – 2014). Universidad Nacional Autónoma de México. 

• Técnico académico (2014 – 2020).  Departamento  de  Recursos  del  Mar,  Centro  de Investigación   y   de   Estudios Avanzados   del   Instituto   Politécnico   Nacional (CINVESTAV-IPN), Unidad-Mérida

• Doctor en Ciencias Marinas (2017  – 2020). Departamento  de  Recursos  del  Mar,  Centro  de Investigación   y   de   Estudios Avanzados   del   Instituto   Politécnico   Nacional (CINVESTAV-IPN), Unidad-Mérida

• Doctor en Ciencias Biológicas – opción Biotecnología de Plantas (2017 – 2020).  Centro de Investigación Científica de Yucatán.  

• Investigador Posdoctoral (octubre de 2020 – agosto 2021). Red de Manejo Bioracional de Plagas y Vectores, Clúster Científico y Tecnológico, Biomimic^® del Instituto de Ecología A.C.  

• Investigador Titular A (septiembre de 2021 – presente). Red de Estudios Moleculares Avanzados  de Estudios Moleculares Avanzados. Clúster Científico y Tecnológico, Biomimic^® del Instituto de Ecología A.C.  

A lo largo de mi carrera me he especializado   en   la   aplicación   de   herramientas  de ingeniería   genética,  bioquímica,   biología  molecular,   ciencias   ómicas (genómica, transcriptómica, proteómica, metagenómica) y bioinformática para el estudio de diversos modelos de plantas, animales y microorganismos, principalmente con el objetivo de comprender los diversos procesos moleculares que ocurren en los organismos en respuesta a diferentes desafíos ambientales, tanto de origen biótico como abiótico.  Ahora esta experiencia está siendo enfocada al área de entomología molecular para el estudio de especies de importancia agrícola y forestal, dentro de las líneas de investigación prioritarias dentro del grupo de trabajo.

Publicaciones

• Monribot-Villanueva, J. L., Altúzar-Molina, A., Aluja, M., Zamora-Briseño, J. A., Elizalde-Contreras, J. M., Bautista-Valle, M. V., ... Ruiz-May, E. (2022). Integrating proteomics and metabolomics approaches to elucidate the ripening process in white Psidium guajava. Food Chemistry, 367, 130656. IF: 7.5

• Aluja, M., Zamora-Briseño, J.A.**, Pérez-Brocal, V., Altuzar-Molina, A., Guillén, L., Desgarennes, D., Vázquez-Rosas-Landa, M., Ibarra-Laclette, E., Alonso-Sanchez, A.G., Moya, A. 2021. Metagenomic survey of the highly polyphagous Anastrepha ludens developing in ancestral and exotic hosts reveals the lack of a stable microbiota in larvae and the strong influence of metamorphosis on adult gut microbiota. Frontiers in Microbiology, 1928. IF: 5.64

• Santana-Cisneros, M.L., Rodríguez-Canul, R., Zamora-Briseño, J.A., Améndola-Pimenta, M., De Silva-Dávila, R., Ordóñez-López, U., Velázquez-Abunader, I., Pedro-Luis, A. 2021. Morphological and molecular identification of Octopoda (Mollusca: Cephalopoda) paralarvae from the southern Gulf of Mexico. Bulletin of Marine Science. 97(2): 281-304. DOI: https://doi.org/10.5343/bms.2020.0027. IF: 1.52

• Hernández-Pérez, A., Zamora-Briseño, J.A., Söderhäll, K., Söderhäll, I. 2021. Gut microbiome alterations in the crustacean Pacifastacusleniusculus exposed to environmental concentrations of antibiotics and effects on susceptibility to bacteria challenges. Dev Comp Immunol. 24:104181. doi: 10.1016/j.dci.2021.104181. IF: 3.49

• Améndola-Pimenta, M., Alcocer-Domínguez, J.C., Sandoval-Gio, J.J., González-Penagos, C.E., Zamora-Briseño, J.A., Ek-Huchim, J.P., Rodríguez-Canul, R. 2021. Differential gene expression induced by acute exposure to water accommodated fraction (WAF) and chemically enhanced WAF (CEWAF) of light crude oil and Nokomis 3-F4 in Limuluspolyphemus larvae. Bull Environ Contam Toxicol. doi: 10.1007/s00128-021-03272-x. IF: 1.66

• Martín-Hernández, R., Rodríguez-Canul, R., Kantún-Moreno, N., Olvera-Novoa, M.A., Medina-Contreras, O., Garikoitz-Legarda, C., Triviño, J.C., Zamora-Briseño, J.A., May-Solis, V., Poot-Salazar, A., Pérez-Vega, J.A., Gil-Zamorano, J., Grant, G., Dávalos, A., Olivera-Castillo, L. 2021. Comparative transcriptomes of the body wall of wild and farmed sea cucumber Isostichopus badionotus. International Journal of Molecular Sciences. 22(8):3882. doi: 10.3390/ijms22083882. IF: 5.9

• Zamora-Briseño, J.A.*, Améndola-Pimenta M, Ortega-Rosas DA, Pereira-Santana A, Hernández-Velázquez IM, González-Penagos CE, Pérez-Vega JA, Del Río-García M, Árcega-Cabrera F, Rodríguez-Canul R. 2021. Gill and liver transcriptomic responses of Achirus lineatus (Neopterygii: Achiridae) exposed to water-accommodated fraction (WAF) of light crude oil reveal an onset of hypoxia-like condition. Environmental Science and Pollution Research. doi: 10.1007/s11356-021-12909-7. IF: 3.06

• Juarez-Escobar, J., Guerrero-Analco, J.A., Zamora-Briseño, J.A., Elizalde-Contreras, J.M., Bautista-Valle, M.V., Bojórquez-Velázquez, E., Loyola-Vargas, V.M., Mata-Rosas, M., Ruíz-May, E. 2021. Tissue-specific proteome characterization of avocado seed during postharvest shelf life. Journal of Proteomics. 235:104112. doi: 10.1016/j.jprot.2021.104112. IF: 3.68

• González-Penagos, C.E., Zamora-Briseño, J.A., Cerqueda-García, D., Améndola-Pimenta, M., Pérez-Vega, J.A., Hernández-Nuñez, E., Rodríguez-Canul R. 2020. Alterations in the gut microbiota of zebrafish (Danio rerio) in response to water-soluble crude oil components and its mixture with a chemical dispersant. Frontiers in Public Health. 8:584953. doi: 10.3389/fpubh.2020.584953. IF: 3.02

• Zamora-Briseño, J.A.*, Pereira-Santana, A., Reyes-Hernández, S.J., Cerqueda-García, D., Castaño, E., Rodríguez-Zapata, L.C. 2020. Towards an understanding of the role of intrinsic protein disorder on plant adaptation to environmental challenges. Cell Stress and Chaperones. 26: 141-150. doi: 10.1007/s12192-020-01162-5. IF: 2.89

• Zamora-Briseño, J.A.*, Cerqueda-García, D., Hernández-Velázquez, I.M., Rivera-Bustamante, R., Huchín-Mian, J.P., Briones-Fourzán, P., Lozano-Álvarez, E., Rodríguez-Canul, R. 2020. Alterations in the gut-associated microbiota of juvenile Caribbean spiny lobsters Panulirus argus (Latreille, 1804) infected with PaV1. Journal of Invertebrate Pathology. 176:107457. doi: 10.1016/j.jip.2020.107457. IF: 2.74

• Cerqueda-García, D., Améndola-Pimenta, M., Zamora-Briseño, J.A., González-Penagos, C.E., Árcega-Cabrera, F., Ceja-Moreno, V., Rodríguez-Canul, R. 2020. Effects of chronic exposure to water accommodated fraction (WAF) of light crude oil on gut microbiota composition of the lined sole (Achirus lineatus). Marine and  Environmental Research. 161:105116. doi: 10.1016/j.marenvres.2020.105116. IF: 3.09

• Zamora-Briseño, J.A.*, Ruiz-May, E., Elizalde-Contreras, J.M., Hernández-Velázquez, I.M., Hernández-Pérez, A., Fuentes-García, A.G., Herrera Salvatierra, N., Briones-Fourzán, P., Pascual-Jiménez, C., Lozano-Álvarez, E., Rodríguez-Canul, R.P. 2020. iTRAQ-basedproteomic profile analysis of the hepatopancreas of Caribbean spiny lobsters infected with Panulirus argus Virus 1: metabolic and physiological implications. Frontiers in Microbiology. 11: 1084. https://doi.org/10.3389/fmicb.2020.01084. IF: 4.44

• Reyes Hernández, S.J., Zamora-Briseño, J.A., Cerqueda-García, D., Castaño, E., Rodríguez-Zapata, L.C. 2020. Alterations in the sap-associated microbiota of Carica papaya in response to drought stress. Symbiosis. DOI: 10.1007/s13199-020-006682-z. IF: 1.75

• Améndola-Pimenta, M., Cerqueda-García, D., Zamora-Briseño, J.A., Cough-Puga, D., Montero-Muñoz, J., Árcega-Cabrera, F., Ceja-Moreno, V., Pérez-Vega, J.A., García-Maldonado, J.Q., del Río-García, M., Zapata, O., Rodríguez-Canul, R.P. 2020. Toxicity evaluation and microbiota response of the lined sole Achirus lineatus (Chordata: Achiridae) exposed to the ligth petroleum water-accomodated fraction (WAF). Journal of Toxicology and Environmental Health, Part A. 83(8):1-17. doi: 10.1080/15287394.2020.1758861. IF: 2.77

• Zamora-Briseño, J.A.*, Pereira-Santana, A., Reyes-Hernández, S.J., Castaño, E. , Rodríguez-Zapata, L.C. 2019. Global dynamics in protein disorder during maize seed development. Genes. 10: 502. doi:10.3390/genes10070502. IF: 3.25

• Hernández-Pérez, A., Zamora-Briseño, J.A.*, Ruiz-May, E., Pereira-Santana, A.,Elizalde-Contreras, J.M., Pozos-González, S., Torres-Irineo, E., Hernández-López, J., Gaxiola-Cortés, M.G., Rodríguez-Canul, R. 2019. Proteomic profiling of the white shrimp Litopenaeus vannamei (Boone, 1931) hemocytes infected with white spot syndrome virus reveals the induction of allergy-related proteins. Developmental and Comparative Immunology. 91: 37-49. doi: 10.1016/j.dci.2018.10.00. IF: 3.19

• Zamora-Briseño, J.A.*, Reyes-Hernández, S.J. y Zapata, L.C.R. 2018. Does water stress promote the proteome-wide adjustment of intrinsically disordered proteins in plants?. Cell Stress and Chaperones. 23(5): 807-812. DOI: 10.1007/s12192-018-0918-x. IF: 2.89

• Gamboa-Tuz, S.D., Pereira-Santana, A., Zamora-Briseño, J.A., Castano, E., Espadas-Gil, F., Ayala-Sumuano, J.A., Keb-Llanes, M.A., Sanchez-Teyer, F., Rodríguez-Zapata, L.C. 2018. Transcriptomics and co-expression networks reveal tissue-specific responses and regulatory hubs under mild and severe drought in papaya (Carica papaya L.). Scientific Reports. 8:14539. DOI:10.1038/s41598-018-32904-2. IF: 4.24

• Siu-Rodas, Y., Calixto-Romo, M.A., Guillén-Navarro, K., Sánchez, J.E., Zamora-Briseño J.A., Amaya-Delgado, L. 2017. Bacillus subtilis with endocellulase and exocellulase activities isolated in the thermophilic phase from composting with coffee residues. Revista Argentina de Microbiología. 50(3): 234-243. doi.org/10.1016/j.ram.2017.08.005. IF: 0.89

• Pereira-Santana, A., Alvarado-Robledo, E.J., Zamora-Briseño, J.A., Ayala-Sumuano, J.T., Gonzalez-Mendoza, V.M., Espadas-Gil, F., Castaño, E., Rodríguez-Zapata, L.C. 2017. Transcriptional profiling of sugarcane leaves and roots under progressive osmotic stress reveals a regulated coordination of gene expression in a spatiotemporal manner. PLoS ONE. 12(12): e0189271. https://doi.org/10.1371/journal.Pone.0189271. IF: 2.77

• Zamora-Briseño, J.A.**, de Jiménez, E.S. 2016. A LEA 4 protein up-regulated by ABA is involved in drought response in maize roots. Molecular Biology Reports. 43(4): 221-8. doi: 10.1007/s11033-016-3963-5. IF: 2.14

Formación de Recursos Humanos

• Aarón Xavier Cantón Bastarrachea. 2016. Análisis in silico y clonación del promotor del factor de transcripción NAC002 de Caricapapaya L. Como requisito parcial para obtener el título de licenciado en biología. Universidad Autónoma de Yucatán.

• Lorena Velásquez Mejía. 2018. Caracterización de la variación genética de poblaciones de lenguados (orden: Pleuronectiforme) en las cercanías de la zona de exclusión de Pemex en la Sonda de Campeche. Como requisito parcial para obtener el título de licenciado en biología marina. Universidad del Mar, Unidad Puerto Ángel.

• Ortega Rosas Daniel Antonio. Transcriptómica comparativa de hígado y branquias del pez plano Achirus lineatus en respuesta a la exposición a petróleo. Como requisito parcial para obtener el título de licenciado en biología marina. Universidad del Mar, Unidad Puerto Ángel.