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Líneas de investigación

• Comunicación planta-bacteria
• Microbiología agrícola
• Microscopía óptica avanzada

Mi investigación se centra en el estudio de las interacciones planta-microorganismo y entender los mecanismos moleculares que conllevan en el establecimiento de las interacciones benéficas y/o patogénicas en el desarrollo y defensa de la planta en organismos modelo de estudio y de interés agrícola, así como entender los procesos de interacción bacteriana (quorum sensing) y búsqueda de nuevos reguladores del quorum sensing de origen microbiano o vegetal. Así como el uso de herramientas de microscopía avanzada (Confocal, SEM y TEM) para el estudio de interacciones planta-microorganismo. Los proyectos de investigación están enfocados en problemáticas de interés nacional con aplicaciones biotecnológicas en el desarrollo de biofertilizantes y agentes de control biológico de plagas y enfermedades en cultivos de interés agrícola.

Coordinador de la Unidad de Microscopía Avanzada (UMA-INECOL)

La Unidad de Microscopía Avanzada, adscrita a la Red de Estudios Moleculares Avanzados (REMAv) del Instituto de Ecología, A.C. (INECOL) es un laboratorio de investigación y de servicios para apoyar a la investigación en las diferentes disciplinas científicas del INECOL, mediante técnicas de microscopía avanzada (Anexo A), para la generación de conocimiento de frontera de alto impacto y la transferencia de tecnología al sector productivo. Además de brindar servicio y asesoría técnica a usuarios del sector público y privado, nacional e internacional, con el objetivo de obtener los mejores resultados en investigación.

Otros servicios que se ofertan en la UMA – INECOL es la formación de recursos humanos mediante la capacitación de estudiantes a nivel licenciatura, posgrado, estancias académicas y/o cursos especializados en microscopía avanzada. Como parte de la apropiación social del conocimiento generado y de divulgación del conocimiento la UMA-INECOL coordina visitas guiadas a grupos de diferentes instituciones educativas del sector público y privado. 

https://www.inecol.mx/index.php/biblioteca/laboratorios/unidad-de-microscopia-avanzada

Síntesis curricular

• Licenciatura en Biología, Facultad de Biología, Universidad Michoacana de San Nicolas de Hidalgo (2005) Tesis: ”Modificación en la arquitectura de la raíz de Arabidopsis thaliana L., por efecto del cromo”. Mención Honorífica.

• Maestría en Biología Experimental, Instituto de Investigaciones Químico-Biológicas, Universidad Michoacana de San Nicolás de Hidalgo (2008) Tesis: “Regulación del desarrollo post-embrionario de la raíz de Arabidopsis thaliana por N-acil-L-homoserina lactonas, una clase de componentes moduladores de la proliferación celular en bacterias” Premio Agrobio México 2009.
• Doctorado en Biología Experimental, Instituto de Investigaciones Químico-Biológicas, Universidad Michoacana de San Nicolás de Hidalgo (2013). Tesis: “Estudio de la participación de las N-acil homoserina lactonas y ciclodipeptidos en la regulación del desarrollo vegetal por bacterias del género Pseudomonas” Mención Honorífica, Premio Weizmann 2014, Mención especial Premio AgroBio México 2013.

Publicaciones

Artículos JCR

• Ortiz-Castro R., Valencia-Cantero E., López-Bucio J. (2008) Plant growth promotion by Bacillus megaterium involves cytokinin signaling. Plant Singnaling & Behavior 3:263-265.
• Ortiz-Castro R., Martínez-Trujillo M., López-Bucio J. (2008) N-acyl-L-homoserine lactones, a class of bacterial quórum-sensing signals alter post-embryonic root development in Arabidopsis thaliana. Plant Cell & Environment 31:1497-1509.
• Ortiz-Castro R., Contreras-Cornejo H.A., Macías-Rodríguez L., López-Bucio J. (2009) The role of microbiol signals in plant growth and development. Plant Signaling and Behavior 4: 1-12.
• Ortiz-Castro R., Díaz-Pérez C., Martínez-Trujillo M., del Río R., Campos-García J., López-Bucio J. (2011) Trans-kingdom signaling based on bacterial cyclodipeptides with auxin activity in plants. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 108(17):7253-7258.
• Ortiz-Castro, R., Valencia-Cantero , E. and López-Bucio, J. (2013) The beneficial role of rhizosphere microorganisms in plant health and productivity: improving root development and nutrient adquisition. Acta Horticulturae (ISHS) 1009:241-250.
• Ortiz-Castro R., Campos-García J., López-Bucio J. (2014) Pseudomonas putida and Pseudomonas fluorescens regulate Arabidopsis root architecture through an auxin mediated pathway and produce bioactive cyclodipeptides. Ecology and Evolution. Under Review.
• Ortiz-Castro R., Pelagio-Flores R., Méndez-Bravo A., Ruíz-Herrera LF., Campos-García J., López-Bucio J. (2014) Pyocyanin, a virulence factor produced by Pseudomonas aeruginosa, alters root development through reactive oxygen species and ethylene signaling in Arabidopsis. Molecular Plant-Microbe Interactions 27:364-378.
• Martínez-Trujillo M, Méndez-Bravo A, Ortiz-Castro R, Hernández-Madrigal F, Ibarra-Laclette E, Ruiz-Herrera LF, Long TA, Cervantes C, Herrera-Estrella L, López-Bucio J (2014) Chromate alters root system architecture and activates expression of genes involved in iron homeostasis and signaling in Arabidopsis thaliana. Plant Molecular Biology 86:35-50 
• López-Bucio J, Ortiz-Castro R, Ruíz-Herrera LF, Vargas-Juárez C, Hernández-Madrigal F, Carreón-Abud Y, Martínez-Trujillo M. (2015) Chromate induces adventitious root formation via auxin signalling and SOLITARY-ROOT/IAA14 gene function in Arabidopsis thaliana. Biometals 28:353-365.
• Jiménez-Vázquez KR, García-Cárdenas E, Barrera-Ortiz S, Ortiz-Castro R, Ruiz-Herrera LF, Ramos-Acosta BP, Coria-Arellano JL, Sáenz-Mata J, López-Bucio J(2020) The plant beneficial rhizobacterium Achromobacter sp. 5B1 influences root development through auxin signaling and redistribution. The Plant Journal 13:1639-1654. Impact factor: 6.417 Q1
• Tzec-Interián JA, Desgarennes D, Carrión G, Monribot-Villanueva JL, Guerrero-Analco JA, Ferrera-Rodríguez O, Santos-Rodríguez DL, Liahut-Guin N, Caballero-Reyes GE, Ortiz-Castro R. (2020) Characterization of plant growth-promoting bacteria associated with avocado trees (Persea americana Miller) and their potential use in the biocontrol of Scirtothrips perseae (avocado thrips). PLOS ONE 15(4):e0231215 Impact factor: 3.240 Q1
• Castillo-Esparza JF, Bandala VM, Ramos A, Desgarennes D, Carrión G, César E, Montoya L, Ortiz-Castro R (2021) Pisolithus tinctorius extract affects the root system architecture through compound production with auxin-like activity in Arabidopsis thaliana. Rhizosphere DOI: 10.1016/j.rhisph.2021.100397. Impact factor: 3.11 Q1
• Gamboa-Becerra R, Desgarennes D, Molina-Torres J, Ramírez-Chávez E, Kiel-Martínez AL, Carrión G, Ortiz-Castro R. (2021) Plant growth-promoting and non-promoting rhizobacteria from avocado trees differentially emit volatiles that influence growth of Arabidopsis thaliana. Protoplasma DOI: 10.1007/s00709-021-01705-2. Impact factor: 3.356 Q1
• Castillo-Esparza JF, Montoya L, Desgarennes D, Carrión G, Ramos A, César E, Ortiz-Castro R, Bandala VM (2023) Bioactivity of Pseudomarasmius nidus-avis and other wild fungi from mesophytic mountain forest in Mexico in control of phytopathogens. Agrociencia 57(3):506-535. DOI: 10.47163/agrociencia.v57i3.2864
• Ramírez-Pool JA, Calderón-Pérez B, Ruiz-Medrano R, Ortiz-Castro R, Xoconostle-Cázares B. (2024) Bacillus Strains as Effective Biocontrol Agents Against Phytopathogenic Bacteria and Promoters of Plant Growth. Microbial Ecology (10.1007/s00248-024-02348-5).

Capítulos de libros

• Ortiz-Castro R., Méndez-Bravo A., López-Bucio J. (2009)Amino compound-containing lipids: A novel class of signal regulating plant development. Plant developmental biology-biotechnological perspectives. Volume 2. Eng-Chong P., Davey M. (Eds). Springer Germany, pp. 209-226.
• Ortiz-Castro R., López-Bucio J. (2010) La arquitectura de las plantas. Fronteras en la biología del desarrollo de las plantas. Beltrán-Peña E., López-Bucio J. (Eds). Universidad Michoacana de San Nicolás de Hidalgo, pp. 1-14.
• Ortiz-Castro R., López-Bucio J. (2013) Small molecules involved in transkingdom communication between plants and rhizobacteria. Molecular Microbial Ecology of the Rhizosphere. Frans J. De Bruijn (Ed). Vol. I, Wiley-Blackwell, New Jersey. pp. 295-307.
• Ortiz-Castro R., Campos-García J., López-Bucio J. (2013) Rapid identification of plant-growth-promoting rhizobacteria system with Arabidopsis. Molecular Microbial Ecology of the Rhizosphere. Frans J. De Bruijn (Ed). Vol. I, Wiley-Blackwell, New Jersey, pp. 345-353.
• Contreras-Cornejo HA., Ortiz-Castro R., López-Bucio J. (2013) Promotion of plant growth and the induction of systemic defence by Trichoderma: Physiology, genetics and gene expression. Trichoderma – Biology and Applications. Mukherjee PK., Horwitz BA., Singh US., Mukherjee M., Scmoll M. (Eds). CAB International. pp. 175-196.

Formación de recursos humanos

Licenciatura

Concluidas

• Lizette Chávez Meza. Facultad de Biología – Universidad Michoacana de San Nicolás de Hidalgo.
• Gerardo Emmanuel Caballero Reyes. Facultad de Biología – Universidad Veracruzana. 
• Karen Adriana Mora Velasco. Química Farmaceútica Biológica- Universidad Veracruzana. 
• Zaida Asunción Hernández Martínez. Ingeniería Bioquímica-Instituto Tecnológico Superior de Xalapa. 
• Narda Guadalupe Pérez Osorio. Ingeniería Bioquímica-Instituto Tecnológico Superior de Xalapa.
• Dulce Lizbeth Santos. Ingeniería Bioquímica-Instituto Tecnológico Superior de Xalapa. 
• Gema Matzil Olguin Utrera. Ingeniería Bioquímica-Instituto Tecnológico Superior de Xalapa. 
• Jared Moctezuma Villalobos. Facultad de Ciencias Químicas. Universidad Veracruzana. 
• María Fernanda Cuevas. Ingeniería Bioquímica-Instituto Tecnológico Superior de Xalapa. 
• Brian Arturo Alarcón. Facultad de Ciencias Agricolas. Universidad Veracruzana. 
• Patricio Ponce Gaona. Licenciatura en Biología-Instituto Tecnológico Superior de Zacapoaxtla. 
• Nayeli Villegas Ortiz. Ingeniería Bioquímica-Instituto Tecnológico Superior de Xalapa. 
• María Ines Torres Martínez. Ingeniería Bioquímica-Instituto Tecnológico Superior de Xalapa.
• Nubia Gervacio Sobrevilla. Ingeniería Bioquímica-Instituto Tecnológico Superior de Xalapa. 
• Blanca Carolina Francisco Francisco. Ingeniería Bioquímica-Instituto Tecnológico Superior de Xalapa. 
• José López Hernández. Facultad de Biología, Universidad Michoacana de San Nicolás de Hidalgo. 
• Ninfa Jiménez Acosta. Facultad de Biología, Universidad Veracruzana. 
• Francisco Jerónimo García. Facultad de Biología, Universidad Veracruzana. 
• Jaqueline de Jesús Jiménez Jiménez. Facultad de Ingeniería Ambiental, Universidad Veracruzana. 
• Esmeralda Ruíz Ruíz. Ingeniería Bioquímica, Instituto Tecnológico Superior de Xalapa. 

 En proceso

• Dulce María Márquez González. Ingeniería Bioquímica, Instituto Tecnológico Superior de Xalapa. Co-Director: Dr. Pedro I. Huerta Venegas 
• Alexis Silva Flores. Ingeniería en Sistemas Computacionales, Instituto Tecnológico Superior de Xalapa. Co-director: Dr. Andrés Montes de Oca Rebolledo.
• Ana Laura Meza Hernández. Ingeniería Bioquímica, Instituto Tecnológico Superior de Xalapa. Co-director: Lic. Biotec. Kenia E. Morales Morales. 
• María Daniela Lara Teutli. Ingeniería Bioquímica, Instituto Tecnológico Superior de Xalapa. Co-director: Biol. Aurora Bermudez Aguas.
• Uriel Dimitri Ordoñez Souza. Ingeniería en Mecatrónica. Instituto Tecnológico Superior de Xalapa. Co-director: Dr. Andrés Montes de Oca Rebolledo. 
• Laura Monserrat Pérez Ortiz. Ingeniería Bioquímica, Instituto Tecnológico Superior de Xalapa. 
• Perla Ariana Castillo Fuentes. Ingeniería Bioquímica, Instituto Tecnológico Superior de Xalapa. Co-director: Dr. Edgar Guevara Avendaño.
• Salem Madai García Elizalde. Ingeniería Bioquímica, Instituto Tecnológico Superior de Xalapa. Co-director: Dr. José Francisco Castillo Esparza
• Victor Efraín Carmona Carmona. Ingeniería Bioquímica, Instituto Tecnológico Superior de Xalapa. Co-director: Dr. Pedro Ivan Huerta Venegas. 
• María Andrea Martínez Moreno. Facultad de Química Farmacéutica Biológica, Universidad Veracruzana. Co-director: Lic. Biotec. Lucero Segura Martínez.  

Maestría

Concluidas

• Jorge Antonio Tzec Interián. Instituto de Ecología, A.C. 
• Santos Emilio Lagunes Zavaleta. Centro de Investigación en Química Aplicada. Director: José Humberto Valenzuela; Co-director: Dr. Randy Ortiz Castro. 
• Pactlic Isabel Camacho Palma. Programa de Maestría en Ciencias en Químico Biológicas de la Sección de Estudios de Posgrado e Investigación de la Escuela Nacional de Ciencias Biológicas del Instituto Politécnico Nacional. 
• Elizabeth Sánchez Zacateco. Centro de Investigaciones en Química Aplicada. Director: José Humberto Valenzuela; Co-director: Dr. Randy Ortiz Castro. 

En proceso

• Lucero Segura Martínez. Instituto de Ecología, A.C. Director de tesis: Dr. Randy Ortiz Castro y Co-Director: Dra. Damaris del Carmen Desgarennes Valido. 
• Aurora Bermúdez Aguas. Instituto de Ecología, A.C. Director de tesis: Dr. Randy Ortiz Castro y Co-director: Dra. Beatriz Palmeros Sánchez. 
• Kenia Elizabeth Morales Morales. Instituto de Ecología, A.C. Director de tesis: Dra. Yoshajandith Aguirre Vidal y Co-director: Dr. Randy Ortiz Castro.
• Francisco Jerónimo García. Instituto de Ecología, A.C. Director: Dr. Randy Ortiz Castro. 
• Fernanda Federica Fernandez Licona. Instituto de Ecología, A.C. Director: Dr. Randy Ortiz Castro; Co-director: Dr. Luis Arturo Ibarra Juárez. 
• Luis Gerardo Domínguez Hernández. Instituto de Ecología, A.C. Director: Dra. Damaris Desgarennes Valido, Co-director: Dr. Randy Ortiz Castro. 
• Andrés Felipe Vargas Amaya. Instituto de Ecología, A.C. Director: Dra. Yoshajandith Aguirre Vidal, Co-director: Dr. Randy Ortiz Castro. 

Estancias Académicas

Asesor de Verano de la Investigación Científica y Tecnológica del Pacífico – DELFIN 

Estudiantes Verano DELFIN 2023:

• Gustavo Adolfo González Franco. Benemérita Universidad Autónoma de Puebla.
• Jaqueline de Jesús Jiménez Jiménez. Universidad Veracruzana. 
• Ricardo Arana Arballo. Universidad de Sonora.

Estudiantes Verano DELFIN 2024:

• Ana Gabriela Cordova Mejía. Benemérita Universidad Autónoma de Puebla. 
• Cinthya Saraí García Vázquez. Universidad Autónoma de Chiapas.
• Carolina Tanessi Arellano Bautista. Benemérita Universidad Autónoma de Puebla.
• Alicia Lozano González. Benemérita Universidad Autónoma de Puebla.