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Líneas de investigación

• Comunicación planta-bacteria

• Microbiología agrícola

Mi investigación se centra en entender los mecanismos moleculares que conllevan en las interacciones planta-bacteria. Durante mis estudios de maestría y doctorado estuve enfocado en los procesos de comunicación entre Arabidopsis thaliana-Pseudomonas aeruginosa, como modelos de estudio, el papel de la comunicación bacteriana (denominado como quorum-sensing) y las respuestas en el desarrollo de la planta. Posteriormente, durante el posdoctorado estuve enfocado en la identificación de aislados bacterianos con potencial uso en el desarrollo de biofertilizantes.

Síntesis curricular

• Licenciatura en Biología, Facultad de Biología, Universidad Michoacana de San Nicolas de Hidalgo (2005) Tesis: ”Modificación en la arquitectura de la raíz de Arabidopsis thaliana L., por efecto del cromo”. Mención Honorífica.

• Maestría en Biología Experimental, Instituto de Investigaciones Químico-Biológicas, Universidad Michoacana de San Nicolás de Hidalgo (2008) Tesis: “Regulación del desarrollo post-embrionario de la raíz de Arabidopsis thaliana por N-acil-L-homoserina lactonas, una clase de componentes moduladores de la proliferación celular en bacterias” Premio Agrobio México 2009.

• Doctorado en Biología Experimental, Instituto de Investigaciones Químico-Biológicas, Universidad Michoacana de San Nicolás de Hidalgo (2013). Tesis: “Estudio de la participación de las N-acil homoserina lactonas y ciclodipeptidos en la regulación del desarrollo vegetal por bacterias del género Pseudomonas” Mención Honorífica, Premio Weizmann 2014, Mención especial Premio AgroBio México 2013.

Publicaciones

Artículos con arbitraje internacional

• Ortiz-Castro R., Martínez-Trujillo M., López-Bucio J., Cervántes C. (2007) Effects of dichromate on growth and root system architecture of Arabidopsis thaliana seedlings. Plant Science 172:684-691.

• Ortiz-Castro R., Martínez-Trujillo M., López-Bucio J., Cervantes C., Carreón-Abud Y. (2008) Restauración del crecimiento radical por nutrimentos inorgánicos en Arabidopsis thaliana L. Expuesta a Cromo. Terra Latinoamericana 27:97-103.

• Campos-Cuevas J.C., Pelagio-Flores R., Raya-González J., Méndez-Bravo A., Ortiz-Castro R., López-Bucio J. (2008) Tissue culture of Arabidopsis thaliana explants reveals a stimulatory effect of alkamides on adventitious root formation and nitric oxide accumulation. Plant Science 174:165-173.

• Ortiz-Castro R., Valencia-Cantero E., López-Bucio J. (2008) Plant growth promotion by Bacillus megaterium involves cytokinin signaling. Plant Singnaling & Behavior 3:263-265.

• Ortiz-Castro R., Martínez-Trujillo M., López-Bucio J. (2008) N-acyl-L-homoserine lactones, a class of bacterial quórum-sensing signals alter post-embryonic root development in Arabidopsis thaliana. Plant Cell & Environment 31:1497-1509.

• Ortiz-Castro R., Contreras-Cornejo H.A., Macías-Rodríguez L., López-Bucio J. (2009) The role of microbiol signals in plant growth and development. Plant Signaling and Behavior 4: 1-12.

• Morquecho-Contreras A., Méndez-Bravo A., Pelagio-Flores R., Raya-González J., Ortiz-Castro R., López-Bucio J. (2010) Characterization of drr1, an alkamide resistant mutant of Arabidopsis, reveals an important role for small lipid amides in lateral root development and plant senescence. Plant Physiology 152:1659-1673.

• Pelagio-Flores R., Ortiz-Castro R., Méndez-Bravo A., Macías-Rodriguez L., López-Bucio J.(2011). Serotonin, a tryptophan-derived signal conserved in plants and animals, regulates root system architecture probably acting as a natural auxin inhibitor in Arabidopsis thaliana.Plant Cell Physiology 52(3):490-508.

• Ortiz-Castro R., Díaz-Pérez C., Martínez-Trujillo M., del Río R., Campos-García J., López-Bucio J. (2011) Trans-kingdom signaling based on bacterial cyclodipeptides with auxin activity in plants. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 108(17):7253-7258.

• Pelagio-Flores R., Muñoz-Parra E., Ortiz-Castro R., López-Bucio J. (2012) Melatonin regulates Arabidopsis root system architecture likely acting independently of auxin signaling. Journal of Pineal Research 53:279-288.

• Pelagio-Flores R., Ortiz-Castro R., López-Bucio J. (2013) dhm1, an Arabidopsis mutant with increased sensitivity to alkamides shows tumorous shoot development and enhanced lateral root formation. Plant Molecular Biology 81:609-625.

• Ortiz-Castro, R., Valencia-Cantero , E. and López-Bucio, J. (2013) The beneficial role of rhizosphere microorganisms in plant health and productivity: improving root development and nutrient adquisition. Acta Horticulturae (ISHS) 1009:241-250.

• Ortiz-Castro R., Campos-García J., López-Bucio J. (2014) Pseudomonas putida and Pseudomonas fluorescens regulate Arabidopsis root architecture through an auxin mediated pathway and produce bioactive cyclodipeptides. Ecology and Evolution. Under Review.

• Ortiz-Castro R., Pelagio-Flores R., Méndez-Bravo A., Ruíz-Herrera LF., Campos-García J., López-Bucio J. (2014) Pyocyanin, a virulence factor produced by Pseudomonas aeruginosa, alters root development through reactive oxygen species and ethylene signaling in Arabidopsis. Molecular Plant-Microbe Interactions 27:364-378.

• López-Bucio J, Hernández-Madrigal F, Cervantes C, Ortiz-Castro R, Carreón-Abud Y, Martínez-Trujillo M. (2014) Phosphate relieves chromium toxicity in Arabidopsis thaliana plants by interfering with chromate uptake. Biometals 27:363-370.

• Raya-González J, Ortiz-Castro R, Ruíz-Herrera LF, Kazan K, López-Bucio J. (2014) PHYTOCHROME AND FLOWERING TIME1/MEDIATOR25 regulates lateral root formation via auxin signaling in Arabidopsis thaliana. Plant Physiology 165:880-894.

• Martínez-Trujillo M, Méndez-Bravo A, Ortiz-Castro R, Hernández-Madrigal F, Ibarra-Laclette E, Ruiz-Herrera LF, Long TA, Cervantes C, Herrera-Estrella L, López-Bucio J (2014) Chromate alters root system architecture and activates expression of genes involved in iron homeostasis and signaling in Arabidopsis thaliana. Plant Molecular Biology 86:35-50.

• López-Bucio J, Ortiz-Castro R, Ruíz-Herrera LF, Vargas-Juárez C, Hernández-Madrigal F, Carreón-Abud Y, Martínez-Trujillo M. (2015) Chromate induces adventitious root formation via auxin signalling and SOLITARY-ROOT/IAA14 gene function in Arabidopsis thaliana. Biometals 28:353-365. 

Capítulos de libros

• Ortiz-Castro R., Méndez-Bravo A., López-Bucio J. (2009)Amino compound-containing lipids: A novel class of signal regulating plant development. Plant developmental biology-biotechnological perspectives. Volume 2. Eng-Chong P., Davey M. (Eds). Springer Germany, pp. 209-226.

• Ortiz-Castro R., López-Bucio J. (2010) La arquitectura de las plantas. Fronteras en la biología del desarrollo de las plantas. Beltrán-Peña E., López-Bucio J. (Eds). Universidad Michoacana de San Nicolás de Hidalgo, pp. 1-14.

• Ortiz-Castro R., López-Bucio J. (2013) Small molecules involved in transkingdom communication between plants and rhizobacteria. Molecular Microbial Ecology of the Rhizosphere. Frans J. De Bruijn (Ed). Vol. I, Wiley-Blackwell, New Jersey. pp. 295-307.

• Ortiz-Castro R., Campos-García J., López-Bucio J. (2013) Rapid identification of plant-growth-promoting rhizobacteria system with Arabidopsis. Molecular Microbial Ecology of the Rhizosphere. Frans J. De Bruijn (Ed). Vol. I, Wiley-Blackwell, New Jersey, pp. 345-353.

• Contreras-Cornejo HA., Ortiz-Castro R., López-Bucio J. (2013) Promotion of plant growth and the induction of systemic defence by Trichoderma: Physiology, genetics and gene expression. Trichoderma – Biology and Applications. Mukherjee PK., Horwitz BA., Singh US., Mukherjee M., Scmoll M. (Eds). CAB International. pp. 175-196.

Dirección de tesis

• Co-asesoría de tesis de licenciatura: “Aislamiento y caracterización de mutantes de Arabidopsis thaliana L., con diferente sensibilidad a Cromo (VI)”, presentada por la estudiante Lizette Chávez Meza para obtener el título de Bióloga, agosto 2008. Facultad de Biología, Universidad Michoacana de San Nicolás de Hidalgo.